在水产生产过程中，常常会发生各种病虫害，以往的解决方法多是使用抗生素、杀虫药等。虽然见效快，但会造成严重的环境污染和鱼体的药物残留，危害人类身体健康。而中草药则有成本低、易收集、无残留、副作用小等优势，是水产养殖病害管理中较好的选择。
中草药在水产中的使用主要有以下四种方法：
1、投喂法。将新鲜的中草药洗净切碎，与饲料拌合后投喂。干的中草药切碎后煮汁，用药汁或连同药渣与饲料拌合喂。
2、泼洒法。将中草药捣碎，用水浸泡后连渣带汁全池泼洒。如果是干草药，必须切碎后煮一段时间再使用。
3、糖化法。把中草药和豆饼、玉米粉、稻草或麸皮混合在一起，经过发酵糖化后喂鱼，可改善中草药的适口性。
4、浸泡法。将中草药捆扎成束，放在进水口或食场附近浸泡，利用泡出的药汁扩散到全池，来防治病害。
中草药常用的品种主要有以下十种：
1、大黄。又名锦纹、黄良，别名将军、生军、马蹄黄等，多年生草本植物。以根、根茎入药，抗菌作用强，抗菌谱广，可防治肠炎病、烂鳃病、白头白嘴病。
2、黄芩。多年生草本植物。以根入药，有抑菌、抗病毒、镇静、利尿解毒等功效，可防治烂鳃病、打印病、败血病、肠炎等。
3、黄连。又名鸡爪连、川连、味连、土黄连，多年生草本植物。以根状茎入药，有抑菌、消炎、解毒功能，主要用于防治细菌性肠炎。
4、黄柏。又名案木、聚皮、元柏，落叶乔木。以树皮入药，有抑菌、解毒、消肿、止痛等功能，可防治草鱼出血病。
5、苦楝。又名楝树，落叶乔木。根、茎、叶、果均可入药，有杀虫、杀菌作用，用于防治寄生虫，如锚头鳋、车轮虫、隐鞭虫、毛细线虫等。
6、五倍子。又名倍子、百药煎、百虫仓等。为漆科植物盐肤本的叶上的干燥虫瘿，由五倍子的蚜虫寄生而成。杀菌能力强，用于防治白头白嘴病、白皮病、赤皮病、疥疮病等。
7、大蒜。以鳞茎入药，所含的大蒜素具有光谱抑菌、止痢、驱虫及健胃功效，常用于防治肠炎病、烂鳃病、锚头鳋病等。
8、乌桕。又名油子树、白桕、木梓树等，落叶乔木。以果、叶入药，有杀菌、消肿作用，常用于防治细菌性烂鳃病、白头白嘴病等。
9、地锦草。又名奶浆草、血见愁、铺地红等，一年生草本。以全株入药，有广谱抗菌、止血散风、清热解毒作用，主要防治肠炎、烂鳃病。
10、水菖蒲。又名水敛草、石菖蒲、石蜈蚣、白菖蒲等，多年生草本。有抑菌、抗真菌作用，可防治肠炎病、赤皮病、烂鳃病、水霉病等。
