西郊农场前身彰化农场系1949 年11 月建立，场部设在彰化村（今四季青南部），1954 年4 月改为现名。
1956年3月，白水洼乡成立。
1958年5月，西郊农场场部迁至上庄村村南（属白水洼乡）。
1958年9月1日，现乡域并入昌平区先锋人民公社。10 月，原白水洼乡大部（除东坨）、 苏家坨乡等地划归海淀区，并入10月7日新成立的海淀区永丰人民公社。
1961年4月，永丰公社撤销，在现乡域成立上庄人民公社，同时设“上庄乡”名义（文化大革命”中取消）。与国营西郊农场实行场乡合一的行政体制。
1984年4月4 日，上庄乡成立，乡政府与西郊农场管理机构合署办公。
1992年2月成立乡农工商总公司（与农场为“一个组织，两个名 称”）。农场国营经济和农村集体经济由农场（总公司）统一经营。下属奶牛、畜禽、工业、建 筑、供销5 个分公司（国营）和4 个分场（集体，即4 个村）。
1986年建立行政村委员会。
1998年11月上庄乡与西郊农场机构分开。
2000年，上庄乡将村委会调整为东马坊村、西马坊村、常乐村、上庄村、北玉河村、西闸村、八家村、皂甲屯村、东小营村、罗家坟村、永泰庄村、南玉河村、李家坟村、梅所屯村、双塔村、前章村、后章村、西辛力屯村、河北村、白水洼村等共20个村委会。
2003年7月，撤上庄乡设立上庄镇。
2014年，上庄镇西马坊村的京西稻（皇家贡米）被列为非物质文化遗产。
