春秋时期，今肃宁县地属晋国。
周显王十九年（前350年），前燕置武垣县（县治在今肃宁县城东南7.8公里）。
赵武灵王二十六年（前300年），武垣属赵国。
西汉，武垣县属幽州涿郡。
新莽时期，武垣改称垣翰亭。
东汉建安十一年（206年），武垣徒治东武垣城（今河间市城南12.5公里），辖域仍含今肃宁全境。初属幽州涿郡，后改隶冀州河间国。三国魏时隶属不变。
西晋时期，武垣县改属冀州高阳郡。
北朝时期，武垣县先后为北魏、东魏、北齐地，隶属于瀛州河间郡。
隋开皇三年（583年），武垣县治迁至瀛州城。开皇十六年（596年），武垣县改名河间县，初属瀛州，大业三年（607年）改隶河间郡。
唐武德五年（622年），复置武垣县。贞观元年（627年），武垣县并入河间县。
后晋高祖天福元年（936年），石敬瑭把幽云十六州割让给契丹，今肃宁境域属契丹。后周显德六年（959年）收复，仍属瀛州。
北宋雍熙三年（986年），在河间县西置平虏寨。景德二年（1005年）改为肃宁城（今肃宁镇）。
金正隆元年（1156年），置肃宁县，属河北东路河间府。
元至元二年（1265），废肃宁县为镇，入河间县，隶中书省河间路。后恢复原建制。
明洪武元年（1368）十月始，肃宁县属河间府。
清代，肃宁县属直隶省河间府。宣统三年（1911年），肃宁归天津河间道。
民国二年（1913年），肃宁县属直隶省渤海道。
民国三年（1914年），属直隶省津海道。
民国十七年（1928年），直隶省改为河北省，肃宁县属之。
民国二十五年（1936年），属河北省沧县行政区。
民国二十六年（1937年），属河北省第六行政督察区。
民国二十七年（1938年）2月，中共肃宁县抗日民主政府成立，属冀中区一专区。
民国二十八年（1939年）2月，改属四专区。
民国二十九年（1940年），肃宁县属冀中区十专区。
民国三十四年（1945）10月，肃宁县改属冀中区八专区。
民国三十五年（1946）7月又改属九专区。
民国三十八年（1949年）8月1日，河北省人民政府成立，肃宁划属沧县地区专员公署。
1952年11月，肃宁县改属定县地区专员公署。
1954年4月，定县地区专员公署撤销，肃宁县复属沧县地区专员公署。
1958年6月15日，撤销沧县地区专员公署，肃宁县改属天津地区专员公署。
1958年11月20日，撤销肃宁县，并入河间县，归天津市管辖。
1962年3月27日，恢复肃宁县建制，隶沧州地区专员公署。
1993年7月，沧州地区与原沧州市合并为地级沧州市，肃宁县隶属沧州市。
