消纯度国家规定棉花杂交种的纯度不低于96%，BT基因度不低于98%，否则就不是合格种子。棉花杂交种子的纯度检验比较复杂，一般农业技术人员和农户都难以进行。但可根据籽粒的外表性状初步鉴定。
净度国家规定棉花杂交种的净度不低于99%，否则也不是合格种子。净度检验标准方法也相对复杂，但也可通过肉眼初步鉴定。
发芽率国家规定棉花杂交种子的发芽率，不低于80%，否则也不是合格种子。棉花杂交种子的发芽率一般农业技术人员和农户自己都可以试验。
种子水分国家规定黄淮地区棉花杂交种子的水分不高于12%，长城以北不高于14%，否则也不是合格种子。
包装棉花杂交种子的包装应符合国家的规定。包装袋上应注明作物名称、种子类别和种子净含量。包装袋内或外应附有种子标签，标签上注明作物名称、种子类别、品种名称和品种审定编号、产地和生产时间、产地检疫证明或证书编号等内容。
棉花杂交种的标准
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